Бывает так, что  в отчете не учтена вся комиссия  (комиссия за платформу, ежемесячная комиссия, дополнительные расходы)

По умолчанию комиссия берётся из отчёта брокера.

Проверьте настройки загрузки отчета, метод расчета комиссии

http://webmarketstat.ru/help/301

В случае если идут незначительные расхождения или выгружаете отчеты только из платформы, но у Вас есть дополнительные расходы по брокерскому счету

То можно воспользоваться инструментом “Корректировка результатов сделок” http://webmarketstat.ru/help/168